الفهرس 
Enteric FeverOnly 14 pages are availabe for public view
 |  | from | 161 |  |  |
| | | from | 161 | | |
Abstract
Typhoid fever remains a significant public health challenge, especially in developing countries. Diagnostic complexities arise from the disease’s non-specific clinical manifestations that overlap with other febrile illnesses. Hence, reliable laboratory testing is crucial. Nested polymerase chain reaction (PCR) stands out for its diagnostic performance, especially when utilizing urine due to its minimal PCR inhibitors and ease of collection.
Aim: The study aimed to test the performance of Salmonella enterica serotype Typhi (Salmonella Typhi) fliC gene specific nested PCR in urine for laboratory diagnosis of typhoid fever.
Subjects and Methods: This observational, cross-sectional study was conducted as an internal pilot study during the period from August 2021 to October 2022. It included 25 clinically diagnosed enteric fever patients, recruited from Al-Abasseya Fever Hospital, Cairo, Egypt, and 25 healthy individuals as controls, matched for age and sex.
Nested PCR was performed to detect the fliC gene of Salmonella Typhi in urine samples from both patients and controls. Urine culture was conducted for subjects in both groups, while blood and stool cultures were exclusively performed for the patients’ group.
Results: The sensitivity of the nested PCR test targeting the fliC gene in urine was 44%, with a specificity of 88%. The positive predictive value was 78.57%, the negative predictive value was 61.11%, the positive likelihood ratio was 3.7, and the negative likelihood ratio was 0.63. Blood culture isolation exhibited a very low positivity rate of 4%.
Conclusion: Nested PCR targeting the fliC gene in urine samples holds promise as a diagnostic tool for typhoid fever. Despite its moderate sensitivity, the relatively higher specificity suggests its potential utility in confirming typhoid fever cases. The test offers a valuable adjunctive tool alongside conventional diagnostic method. However, further research and validation may be necessary before widespread clinical application. The performance of the test needs to be evaluated in clinically diagnosed and laboratory confirmed cases of typhoid fever.
إن حمى التيفود مرض حاد من الأمراض التى تصيب أجهزة متعددة في المريض، تنجم عن سلالة السالمونيلا انتيريكا (و بوجه الخصوص سالمونيلا تيفى)،و هى تنتقل عن طريق تناول المواد الغذائية والسوائل الملوثة بالنفايات البشرية المصابة.
ونظرا لأن المظاهر السريرية للمرض غير محددة ومتشابهة لأمراض الحمى الأخرى، فإن الفحوصات المخبرية ضرورية للتشخيص.
و تعتبر مزرعة الدم الوسيلة التشخيصية لحمى التيفود و بمثابة معيار الذهب للتحقق من المقايسات التشخيصية الجديدة، لكنها لديها حساسية ضعيفة (40 إلى 60٪).
و بالتالى فإن ظهور أساليب جزيئية جديدة للكشف السريع عن السالمونيلا تعتبر أسرع وأكثر حساسية لتشخيص المرض. و يعد الفلاجيلين جين (fliC) لدى السالمونيلا تيفي ، هو تسلسل نيوكليوتيدات فريدة من نوعها و يختلف عن تلك الموجودة في انواع السالمونيلا الأخرى. و بالتالى فإن استخدام اختبارتفاعل البلمرة المتسلسل المتداخل و استهداف هذا الجين، يحسن بشكل كبير من معدل الكشف مقارنة مع الطرق الأخرى.
و لذلك هدفت هذه الدراسة إلى تقييم أداء اختبارتفاعل البلمرة المتسلسل المتداخل للكشف عن الفلاجيلين جين (fliC) في عينات البول لتشخيص حمى التيفود ، وتحديد نمط حساسية السالمونيلا للمضادات الحيوية.
ضمت هذه الدراسة 25 مريضا تم تشخيصهم إكلينيكيا بحمى التيفود، و 25 شخصا صحيحا لتقييم أداء الاختبار. و تم اختيارالمشاركين من المترددين على عيادات مستشفى حميات العباسية بالقاهرة، مصر، في الفترة من أغسطس 2021 إلى أكتوبر 2022.
بالنسبة لمجموعة المرضى، فقد تم جمع المعلومات الطبية منهم، و إجراء اختبارات معملية على العينات المختلفة التي تم سحبها ( دم و بول وبراز) ،من زرع العينات في مزارع خاصة و من ثم فصل الميكروب من العينات في حالة وجوده و التعرف عليه و إجراء اختبارات الحساسية للمضادات الحيوية للعينات المفصولة. كما تم عمل الاختبارات المصلية (فيدال) على عينات الدم الخاصة بالمرضى. و تم إجراء التشخيص الجزيئي لجين الفلاجيلين في عينات البول باستخدام اختبار تفاعل البلمرة المتسلسل المتداخل.
بالنسبة للمجموعة الضابطة من الأصحاء فقد تم أخد عينتين فقط، إحداهما عينة دم لاجراء اختبار فيدال، وعينة بول من أجل عمل مزرعة للبكتريا واستخدام عينة البول أيضا من أجل الشخيص الجزئي لجين الفلاجيلين باستخدام اختبار تفاعل البلمرة المتسلسل المتداخل.
و قد أظهرت نتائج هذه الدراسة أن اختبارتفاعل االبلمرة المتسلسل المتداخل للكشف عن جين الفلاجيلين في عينات البول نجح في تشخيص 92% من المرضى (23 من 25). كما استطاع تشخيص وجود ميكروب السالمونيلا تيفي في 77.7% (7 من 9) من المرضى الذين سبق لهم تناول المضادات الحيوية قبل أخد العينة.
و بالنسبة لآداء هذا الاختبارللكشف عن جين الفلاجيلين، وبالمقارنة مع الطريقة القياسية المستخدمة في هذه الدراسة، فقد وجدنا أن حساسية الاختبارفي عينات البول كانت 92%، بينما كانت الخصوصية 88%.
أما القيمة التنبؤية الإيجابية فقد كانت 88.4%، بينما كانت القيمة التنبؤية السلبية 91.6%، و كانت نسبة الاحتمال الإيجابية 7.6 و نسبة الاحتمال السلبية 0.09، مما يعني أنه اختبار مناسب لاستبعاد إصابة المرضى بحمى التيفود.
و أظهرت اختبارات الحساسية لمجموعات المضادات الحيوية المختلفة، أن 75% (3 من 4) من العزلات المفصولة كانت متعددة المقاومة للمضادات الحيوية.
و قد أوصت الدراسة بإمكانية استخدام اختبار تفاعل سلسلة البوليمريز المتداخل للكشف عن جين الفلاجيلين في تشخيص مرضي حمى التيفود، وبإجراء دراسات أخرى على جين الفلاجيلين في عدد عينات أكبر ومقارنة نتائجه مع نتائج عينات أخرى مثل عينات الدم و البراز