الفهرس 
T UBERCULOSISOnly 14 pages are availabe for public view
 |  | from | 202 |  |  |
| | | from | 202 | | |
Abstract
Background: Tuberculosis is considered one of the major infectious diseases especially in the developing countries and a significant diagnostic and therapeutic challenge worldwide. Gene Xpert MTB/RIF assay is a diagnostic test which depends on a real-time polymerase chain reaction for rapid diagnosis of Mycobacterium Tuberculosis and rifampicin resistance in a single test.
Aim: To evaluate the diagnostic utility of GeneXpert MTB/RIF assay for rapid diagnosis of pulmonary and extrapulmonary tuberculosis as well as the detection of rifampin resistance in specimens obtained from suspected tuberculous patients in Abbassia Chest Hospital.
Patients and Methods: Pulmonary and extrapulmonary samples from 77 cases with suspected TB were collected. All retrieved samples were examined with: direct smear microscopy for AFB, culture for Mycobacterium tuberculosis (L.J. media) along with Drug susceptibility testing (D.S.T.) for positive cultures. As well as the gene Xpert MTB/RIF assay and their results were compared to those of both culture and D.S.T. (as gold standard reference methods).
Results: Gene Xpert MTB/RIF assay showed the highest sensitivity, negative predictive value (NPV) and diagnostic accuracy in detection of pulmonary TB (96.4, 96.4 and 93.1% respectively), with 90%specificity. Xpert MTB/RIF assay showed the lowest sensitivity in diagnosing TB pleural effusion (66.6%) but with the highest specificity and positive predictive value (PPV) (100% for both). As regards diagnosing TB lymphadenitis, gene Xpert MTB/RIF assay showed 75%sensitivity and the lowest specificity (33.3%). Considering rifampin resistance, gene Xpert MTB/RIF assay showed 100% specificity in detection of RIF-Resistance with variable sensitivity according to the type of TB, being the highest in pulmonary TB (90.9% sensitivity).
Conclusion: Gene Xpert MTB/RIF assay could be used as the first line diagnostic tool for diagnosis of pulmonary TB because of its high diagnostic yield. Yet, it’s not recommended to replace the culture for diagnosing extrapulmonary TB especially in diagnosing tuberculous pleural effusion (pauci-bacillary specimens) which has limited diagnostic utility. Also, the assay showed 100% specificity in diagnosing rifampicin resistance guiding physicians to justifiably starting second line anti-TB treatment.
لا زال مرض الدرن (السل) يشكل مشكلة صحية كبيرة في الدول النامية. وفي عام 2019، لقد أصاب حوالي 10 مليون شخص حول العالم و أدى إلى وفاة 1.4 مليون شخص. يعتبر مرض الدرن أحد العشر أسباب الأولى للوفاة حول العالم و يعتبر أيضا˝ السبب الرئيسي للوفاة بسبب ميكروب واحد معدي.
وبالنسبة إلى انتشار مرض الدرن، تعتبر مصر الآن دولة متوسطة إلى قليلة في نسبة الانتشار. فإن معدل الانتشار السنوي المقدر هو 11 لكل 100.000 حالة لحالات الدرن الرئوي النشط الإيجابي و 24 لكل 100,000 حالة لكل أنواع الدرن.
يشكل مرض الدرن خارج الرئة 25% من كل حالات الدرن حول العالم، و خاصة˝ في مرض نقص المناعة (الإيدز) و الأطفال. فإن تشخيصه لا يزال يعتبر تحدي كبير. والسبب هو صعوبة الوصول إلى هذه الأماكن لأخذ العينات مما يؤدي إلى الحصول على عينات بها عدد قليل جدا˝ من عصيات السل و تقليل نسبة حساسية الاختبارات التشخيصية التقليدية.
التحكم في مرض الدرن يحتاج إلى تشخيص وعلاج مبكر، سريع و دقيق. يعتبر الفحص المباشر بالميكروسكوب هو أشهر اختبار معملي يستخدم لتشخيص مرض الدرن. و بالرغم من ذلك، فهو محدود و من الممكن أن يؤدي إلى خطأ في التشخيص. و بالرغم من أنه سريع و غير مكلف، لكنه لديه نسبة حساسية متغيرة من (20-80%) ولا يشخص الدرن المقاوم لأدوية الدرن.
إنما بالنسبة إلى المزرعة الدرنية فهي أساس تشخيص مرض الدرن و أيضا˝ الدرن المقاوم لأدوية الدرن. لكنها تحتاج إلى تكلفة باهظة الثمن و تستغرق وقتا˝ طويلا˝ من 4 الى 8 أسابيع. مما يؤدي إلى التأخير في بدء علاج المرضى و استمرار نقل و انتشار العدوى بين المجتمع.
الدرن المقاوم لأدوية الدرن هو مقاومة ميكروب الدرن للعقارين الرئيسين من الخط الأول لعلاج الدرن على الأقل، و هما: الريفامبين و الأيزونيازيد. و أسباب ظهوره هو تعرض المريض لهذا النوع من ميكروب الدرن المقاوم للعلاج أو عدم انتظام المريض في أخذ علاج الدرن.
بالنسبة للدول ذات الدخل المنخفض، فإن علاج مرض الدرن المقاوم لأدوية الدرن يعتبر أمرا˝ صعبا˝. فإن نظم العلاج تعتبر محدودة، باهظة الثمن و ليست متوفرة معظم الوقت.
إن اختبار الجين اكسبرت هو الاختبار الوحيد التشخيصي الجزيئي لتضخيم الحمض النووي ذاتي الحركة، الذي يستطيع التشخيص السريع لمرض الدرن و المقاومة لعقار الريفامبين معا˝ في نفس الوقت في خلال ساعتين.
و هذا يؤدي إلى التشخيص السريع و الدقيق لحالات مؤكدة معمليا˝ ، و عدم التأخير في بدء العلاج لمرضى الدرن. عندما يشخص اختبار الجين اكسبرت الدرن المقاوم لعقار الريفامبين، فسريعا˝ يبدأ المريض في تلقي الخط التاني من علاج الدرن بدلا˝ من الخط الأول.
قامت منظمة الصحة العالمية بتوصية باستخدام اختبار الجين اكسبرت كاختبار تشخيصي أولي للمرضى المشتبه بهم مرض الدرن الرئوي و الدرن خارج الرئة.
الهدف من الدراسة
إن الهدف من هذه الدراسة هو تقييم اختبار الجين اكسبرت للتشخيص السريع لمرض الدرن (الرئوي و خارج الرئة) و المقاومة لعقار الريفامبين في عينات لمرضى اشتباه الدرن المحجوزين بمستشفى صدر العباسية.