الفهرس 
INTRODUCTION AND AIM OF WORKOnly 14 pages are availabe for public view
 |  | from | 164 |  |  |
| | | from | 164 | | |
Abstract
كان اختبار النمط الجيني لفيروس التهاب الكبد C أسلوبًا أساسيًا قبل بدء العلاج ، فمن الضروري أن يكون لديك فهم أفضل لعلم الأوبئة الجزيئية والتنوع الجيني للأنماط الجينية لفيروس التهاب الكبد الوبائي. NS5B هو بوليميريز RNA المعتمد على 65 كيلو دالتون والذي يتم حفظه بشكل كبير في جميع الأنماط الجينية لـ HCV. كان واحدًا من سبعة بروتينات غير بنائية موجودة في HCV وهو ضروري لتكاثر الفيروس. يعد هذا البروتين هدفًا ممتازًا لتطوير مضاد للفيروسات ذو النمط الجيني ، ومضاد للفيروسات يعمل بشكل مباشر (DAA) مع حاجز مقاومة عالي. كان الهدف من هذا العمل هو التنميط الجيني لسلالات HCV المنتشرة في محافظة الدقهلية من خلال اعتماد التسلسل المباشر ودراسة النشوء والتطور لجزء من جينوم HCV المشفر NS5B من أجل مقارنة بروتين NS5B في النمط الجيني 4a المحلي من HCV مع ذلك الموجود في أخرى. الدول. باستخدام أداة جالفيو للبحث التطوري الجزيئي والتطور ، تم اكتشاف أن جين HCV NS5B من النمط الجيني المحلي 4a المكتشف في مصر كان وثيق الصلة بنظيره في مصر ، EF694396.1: 21-309. وأظهرت تنوعًا جينيًا عاليًا من النمط الجيني 4 من أجزاء أخرى من العالم. كما أوضحت أن العزلات المصرية يمكن تصنيفها إلى أربع مجموعات. تُظهر خوارزمية JNetpred أن البنية الثانوية لبروتين NS5B تتكون من سبع حلزونات ألفا تم تحديدها عند 9-21 (أحماض أمينية EKDIRAEEEVYQC) ، 26-40 (أحماض أمينية PEARKVITALTERLY) ، 70-84 (أحماض أمينية NTLTCYLKATAAIRA) ، 108-120 (VEEDNRALRAFTE) الأحماض الأمينية) ، 122-124 (الأحماض الأمينية MTR) ، 168-175 (الأحماض الأمينية ETPLARAA) ، 184-198 (الأحماض الأمينية VNSWLGNIIVYAPTI) ، وفي 203-214 الأحماض الأمينية VLMTHFFSILQS) و 10 β ورقة في 40-46 (الأحماض الأمينية YVGGPMH) ، 51-55 (الأحماض الأمينية DLCGY) ، 91-94 (الأحماض الأمينية TMLV) ، 99-104 (الأحماض الأمينية LVVIAE) ، 134-140 (الأحماض الأمينية QPAYDLE) ، 142-143 (الأحماض الأمينية IT) ، 149-154 (أحماض أمينية VSVAHD) ، 159-164 (أحماض أمينية KVYYLT) ، 177 (حمض أميني E) وفي 221-233 (أحماض أمينية ALDFDMYGVTYSI). أظهر نموذج التنبؤ بالهيكل ثلاثي الأبعاد لبروتين NS5B لعزلات مختلفة من النمط الجيني 4 أ 4 سلاسل: A و B و Q و R. في الختام ، كان النمط الجيني المصري 4a فريدًا من الناحية الهيكلية ويجب أن يؤدي إلى تطوير مقاومة دوائية فيروسية معينة الآليات التي تؤدي إلى الحاجة إلى ابتكار الأدوية المضادة للفيروسات الخاصة بها