الفهرس 
IntroductionOnly 14 pages are availabe for public view
 |  | from | 173 |  |  |
| | | from | 173 | | |
Abstract
أنواع العصيات هي بكتيريا موجبة الجرام، بوغ التشكيل، على شكل قضيب، هوائية أو لاهوائية اختيارية.
العديد من العوامل المؤهبة المسؤولة عن العدوى البشرية مع العصيات بخلاف الجمرة الخبيثة التي تشمل المرضى الذين يعانون من نقص المناعة وإدمان الكحول المزمن والأجهزة التي توضع في الأوعية الدموية وتعاطي المخدرات عن طريق الوريد والصدمات التي لوحظت على أنها كبيرة.
الطيف السريري للعدوى التي تسببها العصيات تشمل حالات التسمم الغذائي والالتهابات الموضعية (مثل التهابات العين والتهابات الأنسجة الرخوية العميقة) والالتهابات الاجهزة العامة (مثل التهاب حوض الكلي والالتهاب الرئوي والتهاب السحائئ والتهاب الشغاف والتهاب العظم وتجرثم الدم).
التعريف المختبري لـلعصيات. يتضمن صبغة الجرام، وشكل المزرعة وبعض الخصائص البيوكيميائية والفسيولوجية مثل القدرة على النمو اللاهوائي، والحركة، وإنتاج الكاتلاز، واستخدام السترات، واختبار الأوكسيداز.
الوسائط الانتقائية الكروموجينية لتحديد وتمييز بكتيريا B. cereus عن الأعضاء الآخرين في المجموعة، تحتوي هذه الوسائط على ركائز فلورية اصطناعية ومولدة للكروموجينيك التي يتم شقها بواسطة أنشطة إنزيمية محددة. إن دمج هذه الركائز في وسائط انتقائية يسهل ويحسن دقة الكشف والتعرف.
تعمل الأنظمة الاليه لتحديد الميكروبات على تقليل وقت التعرف علي الميكروب وزيادة معدل العينات. تحتوي بطاقة VITEK2 BCL على 46 ركيزة اختبار تقيس أنشطة التمثيل الغذائي المختلفة. يتم تحديد الهوية بعد 14 ساعة من الحضانة. تسمح قاعدة بيانات BCL بتحديد 46 نوعًا من الأجناس.
قياس طيفي لكتلة الطيران بمساعدة مصفوفة الليزر الامتزاز / التأين (MALDI-TOF MS)، والذي يمكن استخدامه لتحليل تركيبة البروتين للخلية البكتيرية، والذي ظهر كتقنية جديدة لتعريف الأنواع. يعد MALDI-TOF MS مناسبًا لتشخيص معدل عينات عالي وسريع بتكاليف منخفضة ويمكن اعتباره بديلاً للتعرّيف الكيميائي الحيوي والجزيئي التقليدي.
MALDI-TOF MS وجد انه مفيد ايضا لتحديد سريع ودقيق للخلايا الخاملة لمجموعة Bacillus anthracis ومجموعة Bacillus cereus وكذلك مجموعات غير Bacillus cereus.
العصيات bacillus spp. (وليس بكتيريا الجمرة الخبيثة) مقاومة بشكل عام للبنسلين والسيفالوسبورينات بسبب إنتاج طيف واسع من إنزيم بيتا لاكتاماز.
العصيات Bacillus Spp.عادة ما تكون عرضة للعديد من فئات الأدوية الأخرى بما في ذلك الفانكومايسين والأمينوغليكوزيدات والماكروليدات والكينولونات وفقًا لـ CLSI M45 (2015).
أجريت الدراسة الحالية خلال الفترة ما بين ديسمبر 2018 وديسمبر 2019 في مستشفيات جامعة عين شمس بالتعاون مع مستشفى 57357، وتم تجميع 30 عينة منفصلة من عينات سريرية مختلفة (دم، مسحة جروح عميقة) من مرضى وحدة العناية المركزة الذين تم تشخيصهم إكلينيكياً بوجود بكتيريا في الدم و المرضي المصابة بجروح عميقة على التوالي، تم تقديم هذه العينات إلى المختبر المركزي للأحياء الدقيقة بمستشفيات جامعة عين شمس للزراعة واختبار حساسية للمضادات الحيوية من ثم عينات Bacillus spp. يتم التعرف على النمط الظاهري بعد إجراءات مختبر علم الأحياء الدقيقة (صبغة جرام، أوكسيديز، كاتلاز واختبار الحركة).
ومن ثم يتم تحديد الأنواع الفرعية بما في ذلك بMALDI-TOF و بطاقات الهوية Vitek @ 2C ووسائط الكروموجينيك وتم اختبارها أيضًا لقياس التركيز المثبط الأدنى للمضادات الحيوية التالية (فانكومايسين - جنتاميسين - سيبروفلوكساسين) عن طريق طريقة تخفيف microbroth لاقتراح توصية لعلاج العصيات .
أظهرت نتائج الدراسة الحالية أن من إجمالي 30 عينة من العصيات بشكل عام، تم عزل 80٪ (24/30) من مزارع الدم و 20٪ (6/30) تم عزلها من الجرح العميق، كما تم عزل 71.4٪ (5/7)من B.subtilis من الجروح العميقة وعزل 28.6٪ (2/7) من B.subtilis من مزارع الدم ايضا 91.4٪ (21/23) من بكتيريا B. cereus تم عزلها من مزارع الدم و 8.6٪ (2/23) من بكتيريا B. cereus تم عزلها من زراعة الجرح.
من بين 30 عينه من Bacillus Spp. بواسطة Vitek-MS أوضحت أن 23/30 (76.66٪) من B.cereus و 7/30 (23.33٪) من B.subtilis.
أيضًا في هذه الدراسة، أظهر نظام Vitek2 Compact بواسطة بطاقات BCL أن 76.66٪ (23/30) عبارة عن B. cereus، 6.6٪ (2/30) B. subtilis، بينما 3.3٪ (1/30) كانت Geobacillus Caldoxylosilyticus، 3.3٪ ( 1/30) كانت Bacillus Coagulans، 3.3٪ (1/30) كانت Bervibacillus Laterosporus و 6.6٪ (2/30) كانت غير معروفة.
أظهر استخدام HichromeTM Bacillus Agar مع استخدام مكمل Polymixin B أن 76.66٪ (23/30) كانت B.cereus، 6.6٪ (2/30) كانت B. subtilis، و 16.6٪ (5/30) تم تثبيطها ولم تظهر أي نمو.
أثناء استخدام Hichrome Bacillus Agar بدون استخدام مكمل Polymixin B، كانت 76.66٪ (23/30) عبارة عن B. cereus، و 16.6٪ (5/30) كانت B. subtilis، وتم تثبيط 6.6٪ (2/30) ولم تظهر أي نمو.
في الدراسة الحالية، لوحظ اتفاق عادل / جيد إحصائيًا بين طريقة نظام vitek MS و Vitek2c فيما يتعلق بنتائج تحديد bacillus spp. (Kappa 0.58)
في العمل الحالي، لوحظ اتفاق عادل / جيد إحصائيًا بين vitek MS و Hichrome Agar مع طريقة التكميل بال polymyxin B فيما يتعلق بنتائج تحديد Bacillus spp (Kappa = 0.58) بينما لوحظ اتفاق ممتاز إحصائيًا بين Vitek MS و Hichrome Agar بدون إضافات فيما يتعلق بنتائج تحديد bacillus spp (Kappa = 0.82)
أيضًا، لوحظ اتفاق ممتاز إحصائيًا بين vitek2C و Hichrome bacillus Agar مع طريقة تكميلية بال polymyxin B فيما يتعلق بنتائج تحديد Bacillus spp (Kappa = 1.0) بينما لوحظ اتفاق عادل / جيد إحصائيًا بين vitek2C و Hichrome bacillus Agar بدون طريقة تكميلية فيما يتعلق بنتائج التعريف Bacillus spp (Kappa = 0.74).
من بين 30 عينة مدروسة باستخدام طريقة المرق الدقيق (BMD) تم الإبلاغ عن 28 (93.3٪) على أنها حساسة للفانكومايسين، 26 (86.6٪) تم الإبلاغ عنها على أنها حساسة للجنتاميسين و 25 (83.3٪) كانت حساسة للسيبروفلوكساسين.